2014年8月17日，拥有两张“农业转基因安全证书”的华中农大失去了证书的有效性。2009年8月17日，农业部给予了华中农业大学“转cry1Ab/cry1Ac基因抗虫水稻华恢1号”和“转cry1Ab/cry1Ac基因抗虫水稻Bt汕优63”的生物安全认定的证书，有效期五年。但对于华中农大以及这个项目的带头人张启发院士来讲，这五年没有发挥任何作用，因为这个证书仅仅是生物安全的证书，与市场化没有任何关系。
“安全证书已经到期了,8月17日，团队继续在申请，如果还想它是活的，就必须申请。至于说能不能拿到，农业部给不给我们，跟过去拿安全证书一样，也不是我们说了算，包括安全不安全是他们评价的结果，所有实验都不是我们做，安委会最后是什么样的结论，我们也不知道，我们就做自己该做的事情，到了期我们再申请，至于农业部给不给我们，就不得而知，当然我们希望他能给我们。”张启发表示。
对于用11年时间来验证生物安全性的成果，张启发虽然显得很轻松，但是毕竟无法释然。“给我们以后还是面临着过去五年同样的难题，给了我们，我们也没有用，既不能往产业化方面走，也没有品种，也没有公司能够接过去生产，也没有公司能够去做产业，也不能去销售，所以这个东西拿在手里还是一张白纸，这后面还有很多很多的问题。”张启发表示。
对于科学研究而言，任何一个研究成果都希望尽快能够得到推广，但是在转基因方面，中国一直是犹抱琵琶半遮面。
事实上，“我国近年来大量进口转基因大豆。”农业部科技教育司转基因生物安全与知识产权处处长寇建平在全国转基因媒体研修班上表示。
转基因之所以发展得慢，似乎与反转人士对转基因的质疑关系并不是那么直接，中国认定的安全的转基因食品仍在进口，转基因木瓜在中国早已全面铺开，转基因棉花种植也在大面积铺开。
“转基因的安全管理是安全的保障基础，我们要通过多个领域的科学家，按我们制定的标准，和一定的程序进行严格安全评价，一个产品到了市场，不是说哪一个个人或者是哪一个单位说了算，你说产业化就产业化，你说不产业化就不产业化，不是的，是要经过很多程序严格审批的，经过严格审批的产品到我们身边安全性应该是有保证的。”寇建平表示。
据寇建平介绍，我国建立了完整的转基因法规体系，国务院有条例，配套的五个办法，有100多个标准，构成了我国转基因安全管理法规体系。中国对转基因的管理是全程管理，从动植物、研究物，一直到进出口，进行的全程管理。
“管理体系非常完整，国务院有一个农业转基因生物安全管理部际联席会议，农业部设转基因安全管理办公室，成立安委会、标委会，农业部还有领导小组，县级以上农业行政主管部门负责本行政区域内的转基因安全管理工作，其他部门依照职能分工履行自己的监管工作，我们的管理体系非常完整。”寇建平表示。
“而在安全评价方面，分四个等级，最低等级是尚不存在危险，一直到低度危险、中度危险、高度危险，不同的等级安全评价严宽也不一样，我们有五个阶段，实验研究、中间实验、安全证书等，环节设置得比较多。申报与审批，我们对外资管得更严，一般是从研究阶段就要向农业部申报审批，国内企业一般到中间实验阶段才是报告制，到后面环境申报阶段进行农业部审批。”
“转基因安全管理总体流程，前期是通过安全评价，通过安全评价之后也不等于产业化，要产业化的话还要符合种植法的有关规定，也要有品种审定，种子生产许可、种子经营许可、种子加工许可，这么多手续办完之后才能产业化，我国发的转基因水稻和玉米以后一直没有产业化，按照种子法的规定后面这些工作还没有做。”寇建平表示。
“其实我们一直在努力去申请种子的生产许可、种子经营许可、种子加工许可，可是相关部门直接告诉我们没有可用申请的程序，怎么把许可给你们。所以从安全证书获得到现在，中国都没有关于转基因种子生产许可的相关文件。”一位转基因水稻的科研人员表示。
2000年修订的《中华人民共和国种子法》中并没有对转基因种子的描述。“据了解，目前已经开始制定转基因种子的相关规定。”上述人士表示。
由此可见，中国做与不做转基因作物，公众的质疑似乎不能阻碍转基因发展的步伐。
中国科学院遗传与发育研究所研究员朱祯在接受《第一财经日报》采访时表示，民众可以说是不知情，民众得到的信息是片面的，在前一个阶段，在非主流媒体上，在新形式媒体上和主流媒体上都是比较负面的东西偏多，这造成了消费者对转基因的疑虑。
而作为政府转基因管理部门官员，寇建平表示，有人说我们农业部不作为，特别是水稻，好像还有其他产业化推进得慢，政府对于转基因品种能不能推广要进行综合评价，主要是考虑几个方面，这些方面都考虑到之后才能进行产业化。首先是安全证书和农民欢迎，这是前提条件和批准基础，到最后批准的时候要进行综合评价，一旦产业化之后，对农业生产、粮食安全、种业安全有什么影响，对经济、国际贸易有什么影响，比如水稻，只有一些零星的扩散，欧盟有退我们的产品，说明已经影响到贸易了，在这种情况下我们在产业化的时候就要考虑到国际贸易，我们还要考虑对环境的影响，一旦种植以后，水稻、大豆，我国是产地国，将来从监管上要进行研究，还要考虑社会公众的接受程度，还要分析知识产权状况，对知识产权也有评价。现在有些研究你中有我我中有你，在中国没有申请专利可能不侵权，比如在印度或者是巴基斯坦、欧盟申领专利的，当产品销售到那个地方的时候就要追究知识产权的责任，在产业化之前先把这些问题都理清楚，都做好前期准备工作，才能推进产业化，不是发了证书就可以推进产业化了，因为转基因技术不同于普通技术，我们专门有一个条例对它进行管理。